Suvereni malteški red s neizmjernom je tugom primio vijest o smrti pape Franje. Veliki meštar fra’ John T. Dunlap zamolio je cijelu obitelj Malteškog reda da se duhovno ujedine u pravu glasa “pape Franje, kojega je Gospodin pozvao k sebi nakon dugih godina neumornog služenja Crkvi i cijelom čovječanstvu. Njegovo svjedočanstvo vjere, njegovo predanje najslabijima, njegov neprestani apel za milosrđem i mirom duboko su obilježili naše vrijeme i nastavit će osvjetljavati put Crkve.”
“Malteški red je uvijek imao podršku i blizinu Svetog Oca u svom služenju bolesnima i najranjivijima”, nastavio je Veliki meštar. Naša je dužnost, danas više nego ikad, zahvaliti za njegov pontifikat i moliti da mu Gospodin udijeli nagradu obećanu vjernim slugama. Molim vas da intenzivirate našu misiju milosrđa u službi naše gospode siromaha i bolesnika kao konkretan znak vjernosti učenju koje nam je papa Franjo prenio i ostavio.”
Papa Franjo je tijekom svog pontifikata primao u audijenciju izaslanstvo Reda u povodu svetkovine sv. Ivana Krstitelja, prateći s velikim zanimanjem i ohrabrenjem godišnje izvješće Velikog meštra o inicijativama Reda u svijetu u korist potrebitih.
Dana 30. siječnja 2023., dan nakon Izvanrednog generalnog kapitula, papa Franjo primio je u audijenciju Velikog meštra Fra’ Johna Dunlapa, zajedno s članovima Suverenog vijeća i Kapitulara, te im udijelio svoj blagoslov: «Blagoslivljam sve vas, vaše obitelji i vaša karitativna djela na svim egzistencijalnim periferijama. Ne zaboravite moliti za mene, jer je moj posao vrlo težak.”